Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gps1Q99LD4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gps1Q99LD4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms