Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tcf23Q9JLR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms