Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933424G06RikA0A140LIP3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms