Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Edf1Q9JMG1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms