Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kif3aP28741 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224 ms