Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tor1aQ9ER39 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tor1aQ9ER39 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms