Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Rnf133Q14B02 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Rnf133Q14B02 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Rnf133Q14B02 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Rnf133Q14B02 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Rnf133Q14B02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf133Q14B02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Rnf133Q14B02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Rnf133Q14B02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf133Q14B02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms