Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnga1P29974 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga1P29974 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms