Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssxb10Q6XAR7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ssxb10Q6XAR7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssxb10Q6XAR7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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