Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3aP28741 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3aP28741 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms