Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx7F8VPJ6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx7F8VPJ6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms