Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r25W4VSP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r25W4VSP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r25W4VSP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r25W4VSP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r25W4VSP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms