Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Knop1Q9Z2Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Knop1Q9Z2Q2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Knop1Q9Z2Q2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Knop1Q9Z2Q2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms