Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubl3Q9Z2M6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubl3Q9Z2M6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubl3Q9Z2M6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms