Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arid3bQ9Z1N7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid3bQ9Z1N7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3bQ9Z1N7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arid3bQ9Z1N7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid3bQ9Z1N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arid3bQ9Z1N7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid3bQ9Z1N7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid3bQ9Z1N7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arid3bQ9Z1N7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arid3bQ9Z1N7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arid3bQ9Z1N7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms