Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setbp1Q9Z180 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setbp1Q9Z180 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Setbp1Q9Z180 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Setbp1Q9Z180 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Setbp1Q9Z180 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Setbp1Q9Z180 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Setbp1Q9Z180 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Setbp1Q9Z180 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Setbp1Q9Z180 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Setbp1Q9Z180 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms