Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shcbp1Q9Z179 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1Q9Z179 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1Q9Z179 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shcbp1Q9Z179 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1Q9Z179 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms