Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ApipQ9WVQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ApipQ9WVQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ApipQ9WVQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApipQ9WVQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms