Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PapolbQ9WVP6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PapolbQ9WVP6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PapolbQ9WVP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PapolbQ9WVP6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms