Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scnn1gQ9WU39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scnn1gQ9WU39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scnn1gQ9WU39 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1gQ9WU39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1gQ9WU39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms