Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh13Q9WTR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh13Q9WTR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh13Q9WTR5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms