Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema6cQ9WTM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema6cQ9WTM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema6cQ9WTM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms