Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W5

Calcrl, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcrlQ9R1W5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CalcrlQ9R1W5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CalcrlQ9R1W5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CalcrlQ9R1W5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CalcrlQ9R1W5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CalcrlQ9R1W5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms