Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cry2Q9R194 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cry2Q9R194 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cry2Q9R194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cry2Q9R194 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cry2Q9R194 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cry2Q9R194 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms