Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt71Q9R0H5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt71Q9R0H5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt71Q9R0H5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt71Q9R0H5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms