Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AmfrQ9R049 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AmfrQ9R049 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AmfrQ9R049 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AmfrQ9R049 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AmfrQ9R049 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AmfrQ9R049 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AmfrQ9R049 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms