Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a4Q9QZR9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col4a4Q9QZR9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col4a4Q9QZR9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col4a4Q9QZR9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms