Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Plxnb3Q9QY40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxnb3Q9QY40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxnb3Q9QY40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxnb3Q9QY40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Plxnb3Q9QY40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb3Q9QY40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms