Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Apbb1Q9QXJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Apbb1Q9QXJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apbb1Q9QXJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apbb1Q9QXJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apbb1Q9QXJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apbb1Q9QXJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms