Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-OaQ9QWV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-OaQ9QWV1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-OaQ9QWV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-OaQ9QWV1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-OaQ9QWV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms