Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma6Q9QUM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma6Q9QUM9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma6Q9QUM9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms