Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cln8Q9QUK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cln8Q9QUK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln8Q9QUK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln8Q9QUK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln8Q9QUK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln8Q9QUK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms