Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cabp1Q9JLK7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cabp1Q9JLK7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cabp1Q9JLK7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cabp1Q9JLK7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cabp1Q9JLK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms