Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hip1rQ9JKY5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hip1rQ9JKY5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Hip1rQ9JKY5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hip1rQ9JKY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hip1rQ9JKY5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms