Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx20Q9JJY4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx20Q9JJY4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx20Q9JJY4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx20Q9JJY4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ddx20Q9JJY4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx20Q9JJY4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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