Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FliiQ9JJ28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FliiQ9JJ28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FliiQ9JJ28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FliiQ9JJ28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FliiQ9JJ28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms