Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc12a4Q9JIS8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc12a4Q9JIS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a4Q9JIS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a4Q9JIS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms