Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppp1r3fQ9JIG4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppp1r3fQ9JIG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppp1r3fQ9JIG4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms