Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RabggtaQ9JHK4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RabggtaQ9JHK4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RabggtaQ9JHK4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RabggtaQ9JHK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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