Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pgpep1Q9ESW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pgpep1Q9ESW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pgpep1Q9ESW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgpep1Q9ESW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pgpep1Q9ESW8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pgpep1Q9ESW8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pgpep1Q9ESW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pgpep1Q9ESW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pgpep1Q9ESW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pgpep1Q9ESW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pgpep1Q9ESW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Pgpep1Q9ESW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pgpep1Q9ESW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms