Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4bQ9ES61 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4bQ9ES61 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms