Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc4Q9ES56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc4Q9ES56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc4Q9ES56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc4Q9ES56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms