Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3bQ9ES34 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3bQ9ES34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ube3bQ9ES34 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube3bQ9ES34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube3bQ9ES34 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ube3bQ9ES34 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ube3bQ9ES34 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube3bQ9ES34 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms