Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim54Q9ERP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim54Q9ERP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim54Q9ERP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim54Q9ERP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim54Q9ERP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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