Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr4Q9EP82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr4Q9EP82 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Wdr4Q9EP82 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr4Q9EP82 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms