Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r52Q9EP79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r52Q9EP79 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r52Q9EP79 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r52Q9EP79 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r52Q9EP79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r52Q9EP79 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r52Q9EP79 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r52Q9EP79 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms