Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl4Q9DCU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl4Q9DCU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl4Q9DCU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl4Q9DCU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mrpl4Q9DCU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl4Q9DCU6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl4Q9DCU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl4Q9DCU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms