Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MNCb-2875Q9DCB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MNCb-2875Q9DCB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MNCb-2875Q9DCB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms