Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Med29Q9DB91 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med29Q9DB91 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med29Q9DB91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Med29Q9DB91 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med29Q9DB91 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms