Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf7Q9DAG9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf7Q9DAG9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf7Q9DAG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf7Q9DAG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf7Q9DAG9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms